引物設(shè)計(jì)軟件oligo 7 v7.56破解版

oligo7破解版通過專用的注冊(cè)機(jī)，注冊(cè)破解好的一款引物設(shè)計(jì)軟件，它的主要功能就是設(shè)計(jì)和分析序列和PCR引物，合成基因和各種探針，包括小分子干擾核苷酸和分子信標(biāo)的工具。它分為三種圖，分別為Frq圖、Tm圖和ΔG圖，能夠更好的幫助初學(xué)者進(jìn)行軟件的使用和學(xué)習(xí)。另外該如軟件還具備基于最近鄰熱力學(xué)數(shù)據(jù)，低聚糖的搜索算法尋找最佳引物PCR，包括TaqMan、高度多路復(fù)用，共識(shí)或簡并引物，支持多個(gè)文件的批處理，非常適合使用與生物和化學(xué)中。軟件學(xué)堂提供下載，內(nèi)附有注冊(cè)機(jī)，在下文附有軟件的安裝破解教程，需要的朋友歡迎前來下載！

破解教程

安裝前注意：在安裝之前必須要先確認(rèn)電腦上是否安裝了java運(yùn)行環(huán)境，若沒有安裝，請(qǐng)安裝一個(gè)，推薦安裝：JRE 9。
1、在軟件學(xué)堂下載好軟件包，你會(huì)得到如下圖所示的幾個(gè)文件，雙擊運(yùn)行主應(yīng)用程序。

2、根據(jù)軟件的安裝指導(dǎo)完成軟件的安裝。

3、軟件安裝完成后，雙擊桌面上的快捷方式打開軟件。

4、打開軟件后，在如阿健界面找到“Workstation Code”信息，如下圖所示的位置。

5、打開oligo7破解版軟件包里面的“keygen”文件下面的“Keygen.exe”注冊(cè)機(jī)，將上一步的Workstation Code”信息復(fù)制到注冊(cè)機(jī)中，然后點(diǎn)擊“Generate”，會(huì)生成一串激活碼。

6、再將“Access Code”后面的激活碼復(fù)制到軟件中的“Access Code:”文本框中。

7、然后點(diǎn)擊“Confirm Code”即可破解完成

使用教程

1、首先，同Oligo 6 一樣，F(xiàn)ile菜單下，選擇New sequence ,打開窗口將目的序列粘貼進(jìn)來，或是選擇Open定位到目的cDNA序列（在primer中，該序列已經(jīng)被保存為Seq文件），這是最初打開時(shí)的界面：

2、然后就是進(jìn)行引物的設(shè)計(jì)了。Search 菜單下，選擇for primes &probes ,即出現(xiàn)引物搜尋窗口:

3、根據(jù)自己的實(shí)際情況選擇Parameters 或Ranges設(shè)置引物的相關(guān)參數(shù)和范圍。然后選擇Search即開始進(jìn)行引物的搜索，之后會(huì)出現(xiàn)軟件所列出的依據(jù)得分（Score）高低排列設(shè)計(jì)的引物。 

4、雙擊每一行所列出的引物會(huì)彈出該對(duì)引物的具體信息，以及oligo7破解版對(duì)該對(duì)引物的相關(guān)評(píng)價(jià)。

5、雙擊之后在最初的Sequence 窗口中就會(huì)出現(xiàn)下面的窗口:  

6、點(diǎn)擊綠色方形圖標(biāo)前面的i標(biāo)志可了解對(duì)應(yīng)的具體信息。

7、之后便是對(duì)該引物的具體分析了，這部分的分析同Oligo 6基本上是一樣的。 選擇Analyze菜單，如下圖：

（1）Analyze中，第一項(xiàng)為Key info，點(diǎn)擊Selected primers，會(huì)給出兩條引物的概括性信息，其中包括引物的Tm值，此時(shí)軟件是采用nearest neighbor method計(jì)算，會(huì)比Primer5中引物的Tm值略高，此窗口中還給出引物的Delta G和3’端的Delta G.3’端的Delta G過高，會(huì)在錯(cuò)配位點(diǎn)形成雙鏈結(jié)構(gòu)并引起DNA聚合反應(yīng)，因此此項(xiàng)絕對(duì)值應(yīng)該小一些，最好不要超過9。
（2）Analyze中第二項(xiàng)為Duplex Formation，即二聚體形成分析，可以選擇上游引物或下游引物，分析上游引物間二聚體形成情況和下游引物間的二聚體情況，還可以選擇Upper/Lower ，即上下游引物之間的二聚體形成情況。引物二聚體是影響PCR反應(yīng)異常的重要因素，因此應(yīng)該避免設(shè)計(jì)的引物存在二聚體，至少也要使設(shè)計(jì)的引物形成的二聚體是不穩(wěn)定的，即其Delta G值應(yīng)該偏低，一般不要使其超過4.5kcal/mol，結(jié)合堿基對(duì)不要超過3個(gè)。Oligo此項(xiàng)的分析窗口中分別給出了3’端和整個(gè)引物的二聚體圖示和Delta G值。
（3）Analyze中第三項(xiàng)為Hairpin Formation，即發(fā)夾結(jié)構(gòu)分析?？梢赃x擇上游或者下游引物，同樣，Delta G值不要超過4.5kcal/mol，堿基對(duì)不要超過3個(gè)。
（4）Analyze中第四項(xiàng)為Composition and Tm，會(huì)給出上游引物、下游引物和產(chǎn)物的各個(gè)堿基的組成比例和Tm值。上下游引物的GC％需要控制在40％～60％，而且上下游引物之間的GC％ 不要相差太大。Tm值共有3個(gè)，分別采用三種方法計(jì)算出來，包括nearest neighbor method、％GC method和2(A＋T)＋4(G＋C)method，最后一種應(yīng)該是Primer5所采用的方法，Tm 值可以控制在50～70度之間。
（5）第五項(xiàng)為False Priming Sites，即錯(cuò)誤引發(fā)位點(diǎn)，在Primer5中雖然也有False priming分析，但不如oligo詳細(xì)，并且oligo會(huì)給我正確引發(fā)效率和錯(cuò)誤引發(fā)效率，一般的原則要使誤引發(fā)效率在100以下，當(dāng)然有時(shí)候正確位點(diǎn)的引發(fā)效率很高的話，比如達(dá)到400～500，錯(cuò)誤引發(fā)效率超過100幅度若不大的話，也可以接受。
（6）Analyze中，有參考價(jià)值的最后一項(xiàng)是“PCR”，在此窗口中，是基于此對(duì)引物的PCR反應(yīng)Summary，并且給出了此反應(yīng)的最佳退火溫度，另外，提供了對(duì)于此對(duì)引物的簡短評(píng)價(jià)。若該引物有不利于PCR反應(yīng)的二級(jí)結(jié)構(gòu)存在，并且Delta G值偏大的話，在最后的評(píng)價(jià)中會(huì)注明，若沒有注明此項(xiàng)，表明二級(jí)結(jié)構(gòu)能值較小，基本可以接受。
(7)另外，Internal stability也很重要，最好是中間高兩邊低的弧形。

功能介紹

1、分析TM和內(nèi)部穩(wěn)定性，繪制溶解溫度圖和穩(wěn)定性圖
2、給出寡核苷酸的重要相關(guān)信息
3、顯示正向引物、反向引物和當(dāng)前的OLIGO里潛在的連接物，潛在的二聚物也可顯示出來
4、分析顯示在選中的正向引物或反向引物中基本的成份和溶解溫度
5、精確地分析出生物信息軟件中的錯(cuò)配位點(diǎn)
6、正向引物和反向引物選中后，能自動(dòng)產(chǎn)生PCR實(shí)驗(yàn)條件和PCR產(chǎn)物信息

軟件特色

1、使用方面還是比較的靈活
2、操作的話也得到了大家的任何
3、功能方面也比較的全面
4、雖然是英文的操作界面，也不會(huì)影響用戶進(jìn)行使用

小編點(diǎn)評(píng)

這款軟件功能全面，方便快捷，而且在使用方便也是非常靈活的，需要的朋友可以免費(fèi)下載嘗試體驗(yàn)哦！